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  1. scaffold 在基因中是什么? 希望能清楚点解释 - 知乎

    scaffold 其实是基因组组装时的概念。涉及到的相关概念如下: reads:就是我们测序产生的短读序列,通常一代和三代的reads读长在几千到几万bp之间,二代的相对较短,平均是几十到几 …

  2. 如何设计crisper-dcas9系统的gRNA,具体步骤是什么? - 知乎

    tracrRNA(在CRISPR-Cas9编辑技术中被优化并命名为gRNA scaffold),它负责与Cas9结合,与重复序列具有同源性。 crRNA为引导序列,约20个碱基,具有特异性。 其中,crRNA …

  3. 如何oku? - 知乎

    scaffold直接翻译过来是脚手架。 这个概念和“测末端”有关。 简单地说,你测序的时候筛选到了20kb长的片段,但是一代和二代都测不通,只能测两端很短的序列。 这时候你有了这个20kb …

  4. 常见的Cas12a酶类它们的crRNA的直接重复序列(又名DR区 …

    关于Cas12a crRNA的直接重复序列(DR区或Scaffold区)的具体序列,这个信息可以因物种来源的Cas12a酶而异。 通常,DR序列是crRNA中高度保守的部分,它在生物体的CRISPR阵列中 …

  5. 如何将sgRNA和sgRNA scaffold连接到cas9载体上? - 知乎

    SgRNA scaffold设计:sgRNA scaffold是一个特定的RNA结构,它与SGRNA结合并促进Cas9蛋白的切劃活性通常,sgRNA scaffold的序列是已知的,并且可以在许多载体中找到。 2.准备Cas9 …

  6. 截止 2022 年,联邦学习有哪些成熟的框架或惊艳的应用? - 知乎

    SCAFFOLD: Stochastic Controlled Averaging for On-Device Federated Learning Improving Federated Learning Personalization via Model Agnostic Meta Learning (NIPS 2019 Workshop) …

  7. 编程中的脚手架是什么意思? - 知乎

    The compiler uses this specification to generate code that the application can use to create, read, update and delete database entries, effectively treating the template as a "scaffold" on which …

  8. 两个物种的共线性图怎么做? - 知乎

    修改前,spe840-Pt是未组装到拟南芥5条染色体上的scaffold 拟南芥染色体按照spe840-1到spe840-5的正顺序,水稻染色体我设置的倒序,这里你怎么设置顺序,最终图上就是什么顺序 …

  9. cas12a的crRNA该怎么去设计与寻找? - 知乎

    最近Marraffini团队发表在MC上发表的一篇文献介绍了如何设计高效的Cas13a-crRNA(marraffini.rockefeller.edu)值得我们去学习应用,大家如果有在做Cas13a检测的可 …

  10. 转录组数据分析中,参考基因组Scaf有用吗? - 知乎

    对于那些无法明确对应到参考基因组上的未挂载片段(通常标记为"scaffold"或"contig"),处理方式取决于你的具体研究目标和可用的数据质量。 以下是一些建议: 1) 尝试匹配:首先,尽可 …